祁连山区还是野生动物的乐园。白唇鹿是国家级保护动物,体型高大,唇为白色,故名。马麝主要生活在祁连山区的茂密灌木丛中,俗称香獐、香麝,盘羊又名大头羊、大角羊,其雄者角特别长,最长可达九十厘米,体重可达二百斤,野牦牛体躯高大粗壮,体重超千斤,亦为国家级保护动物,雪豹也是稀有动物,它的皮、毛细密而柔软,花纹美丽,是难得的上等皮料。
祁连山的矿产资源也十分丰富,玉门有油田,走廊南山有特殊的铣铁矿,还有大量的煤、铬、铜、锌、硫磺矿等。酒泉附近的山中还盛产玉石,可雕成夜光杯。
祁连山的冰川旅游,别具风味。嘉峪关市最近在祁连山兴建了一个冰川旅游区。这一冰川位于祁连山海拔4300米的中段,面积4平方公里,坡度小于45度,易于攀登。目前旅游区建有五公里长的登山道路,在海拔3700米的草地上建立了宿营地,并建有避雨室和“寿山不老,为雪白头”的勘探冰J11纪念碑等建筑。